医院坚持“以病人为中心”，共建救助平台，心系关爱患者民生。秉持“初心不忘，乐善始终”的理念，香港大学深圳医院设立了“港深乐善公益项目”。截至2021年12月，医院因坚持公益善举获得港深两地社会慈善捐赠逾 1.4 亿元，在医疗领域的公益慈善事业树立了典范。

港深乐善公益项目宗旨及目的为缔造港深医疗公益平台，以弘扬绿色文化，倡导以人为本的医疗人文精神，发挥社会机构和个人力量，帮助贫弱危重患者和病友扶助；加快推动香港大学深圳医院服务提升和整体发展，以更好造福市民和患者。

港深乐善公益项目五大重点使用范围

赠医施药

救济贫弱患者丶开展大病救助丶支持病友会发展等;

设施提升

改善医疗设备和医院设施，为患者和市民提供更好服务;

医学研究

推动医学技术研究，包括前瞻性的重点医学项目;

教学培训

开展广泛的医疗教学和培训项目，促进医学传承发展;

绿色文化

弘扬医学人文关怀，倡导绿色医疗理念的推广和应用。

有赖于深港爱心人士慈善捐赠，医院得以建设院内医学生宿舍、改造院内会议室、升级教学培训硬件、购置医疗设备，并成立了中毒救治中心，有效提升了医院临床及科研教学服务水平。

部分慈善捐赠：

核磁共振仪（MRI）：香港企业家罗守辉先生

直线加速器：香港方树福堂基金、香港方润华基金

康复中心：香港周大福慈善基金

中风治疗及康复领域：R.G Investment Limited

内分泌及代谢病领域：永光集团管理有限公司

临床技能培训及会议中心：香港陈黄志兰女士

深培轩：上海广南房地产发展有限公、孔德明堂慈善基金有限公司

防疫捐赠：Toyo Mall Limited、冼为坚基金有限公司、冼为坚基金有限公司等

香港大学深圳医院中毒治疗中心建设：黄锡金先生

儿童公益空间：深圳中小企联晴娃娃基金

香港方树福堂基金和方润华基金慷慨捐赠善款，用于购买直线加速器救治肿瘤患者

香港爱心企业家罗守辉先生慷慨捐赠，助添磁共振设备(MRI)，并设立“港深乐善医学影像中心”

香港大学深圳医院倡导廉洁行医文化。2013年初，医院在深圳率先推出新举措，设立了“病人紧急援助专项基金”，将无法退还的“红包”纳入该基金，而无法退还的礼品则通过公开拍卖的方式，将拍得资金纳入其中，用于资助医院困难病人。